La journée « Jeunes chercheuses et chercheurs en informatique
et ses liens avec la biologie » se tiendra le mercredi
14 octobre 2026, dans l’amphithéâtre
Choquet-Bruhat de l’IHP, Paris.
Organisée dans le cadre de l’année thématique « ADN dans tous ses états
», cette journée vise à réunir de jeunes chercheuses et
chercheurs en informatique autour de questions, de méthodes et d’objets
pouvant entrer en dialogue avec la biologie.
L’appel s’adresse à un public large en informatique. Il ne se limite
pas à la bio-informatique ni aux travaux directement issus de la
biologie computationnelle. Nous souhaitons au contraire faire apparaître
la diversité des approches informatiques susceptibles d’éclairer, de
formaliser, de modéliser, d’analyser ou de questionner des phénomènes,
données ou structures liés au vivant.
La journée comprendra deux exposés invités :
- Yann Ponty, sur la combinatoire des structures de
l’ARN ;
- Amélie Gheerbrant, sur les bases de données graphes
et les ontologies, avec des illustrations sur des données
biologiques.
Contributions attendues
Nous invitons les doctorantes, doctorants, post-doctorantes et
post-doctorants à proposer une présentation de leurs travaux de
recherche.
Les contributions pourront porter sur un article accepté ou soumis,
qu’il s’agisse d’un travail théorique, méthodologique, expérimental ou
appliqué. L’objectif est de favoriser les échanges entre différentes
communautés de l’informatique et de donner à voir la variété des liens
possibles entre informatique et biologie.
Modalités de soumission
Chaque soumission devra contenir un titre, un résumé de la
contribution, le nom, l’affiliation et le statut de la personne
proposant la présentation, ainsi qu’un lien vers un manuscrit
correspondant déposé sur une archive ouverte, par exemple HAL, arXiv ou
toute autre archive accessible publiquement.
Les soumissions sont à envoyer avant le 7 Septembre
à l’adresse suivante via EasyChair.
Sélection
La sélection des contributions visera à représenter une diversité de
sujets, de méthodes et de communautés de recherche en informatique et en
biologie. La priorité sera donnée à la construction d’un programme
équilibré, permettant à un public large de découvrir des travaux récents
et de susciter des discussions transversales.
Appel à problèmes
En parallèle de l’appel à contributions, nous lançons un
appel à problèmes.
Nous invitons toute personne disposant d’un problème algorithmique
intéressant, bien délimité et auto-contenu, à le proposer afin qu’il
puisse être porté à la connaissance de la communauté. Ces problèmes
peuvent provenir de questions biologiques, de situations de
modélisation, de structuration ou d’analyse de données, ou plus
généralement de contextes où une formulation informatique pourrait
ouvrir de nouvelles pistes.
Chaque proposition devra présenter clairement le problème, son
contexte, les données disponibles le cas échéant, ainsi que les
questions ouvertes ou verrous identifiés. Les problèmes retenus seront
transmis aux participantes et participants de la journée et pourront
être diffusés plus largement dans le cadre de l’année thématique
« ADN dans tous ses
états ».
Les propositions de problèmes sont à envoyer avant le 7
Septembre par mail à : charles.paperman@univ-lille.fr
et camille.marchet@univ-lille.fr.
La journée aura lieu le mercredi 14 octobre 2026,
dans l’amphithéâtre Choquet-Bruhat de l’IHP,
Paris.